lunes, 10 de octubre de 2016

Probablemente la bacteria más abundante de la Tierra

Por Israel Pimentel


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Figura 1. Pelagibacter ubique
Pelagibacter ubique pertenece al clado SAR11, este clado consiste en alfa proteobacterias heterótrofas marinas muy pequeñas (aproximadamente <1µm) que se encuentran  lo largo de los océanos, donde representan al rededor del 25% de todas las células bacterianas. Pelagibacter ubique fue el primer organismo cultivado del clado SAR11, y tiene el genoma más pequeño y codifica la menor cantidad de marcos de lectura abiertos conocidos para un microorganismo de vida libre. A diferencia de las bacterias y archaea con genomas pequeños, P. ubique posee rutas biosintéticas completas para todos los aminoácidos y la mayor parte de cofactores. P. ubique no tiene pseudogenes, intrones, transposones, elementos extracromosómicos o "inteins"; pocos parálogos; y los espaciadores intergenéticos más cortos observados en cualquier célula.

Clasificación taxonómica: 
Dominio: Bacteria
Filo: Proteobacteria
Clase: Proteobacteria alfa
Orden: Rickettsiales
Género: Pelagibacter
Especie: Pelagibacter ubique Rappé, 2002. 

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Figura 2. Grupo de Pelagibacter ubique
Pelagibacter ubique es de los heterótrofos más abundantes en la Tierra; y fue descubierto a principios de 1990. Como Roseobacter, Pelagibacter ubique participa en fotoheterotrofía utilizando un tipo de rodopsina. Aparentemente, la heterotrofía fotoasistida es una estrategia metabólica común en los microbios pequeños que viven en aguas donde los nutrientes no son muy abundantes (cuerpos de agua oligotróficos). 

Referencias 
Giovannoni, S. J. et al. 2005. Genome streamlining in a cosmopolitan oceanic bacterium. Science. Vol. (309), 1242-1245. 

Libes, S. 2011. Introduction to marine biogeochemistry. 2da. ed.  Conway, South Carolina. Academmic Press. 928 págs.  

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