sábado, 24 de septiembre de 2016

Pelomyxa, la ameba gigante





Pelomyxa  es un género de protistas ameboides flagelados gigantes. Estas poseen una membrana nuclear pero carecen de retículo endoplasmático, cuerpos Golgi, mitocondria, cromosomas o centrioles. Pelomyxa se considera microespifílica, lo que quiere decir que al no tener mitocondría estas requieren menos oxígenos que las eucariotas. Para contrarestar la ausencia de la mitocondría esta ameba gigante tiene tres tipos de endosimbiontes. Uno de ellos está al rededor del núclo y se les conoce como bacterias perinucleares, y el otro están dispersas en el citoplasma (Margulis y Chapman, 2009). 

Figura 1. Corte longitudinal de Pelimyxa palutris y diagramación de bacterias simbiótcas



Reino
Protista
Filo
Amoebozoa
Subfilo
Conosa
Clase
Archamoebae
Orden
Pelobiontida
Familia
Pelomyxidae
Género
Pelomyxa
GREEF 1984


Ahora, su ciclo de vida se ha descrito como complejo. En la primavera, quistes liberan pequeñas amebas binucleadas, las cuales crecen y se convierten en multnucleadas y adquieren una bacterias endosimbiótica. Estas se alargan y se genera un uroide posterior y un flagelo. Las células luego adquieren una forma esférica y la bacteria endosimbiótica se coloca al rededor del núcleo. Estas celulas se fragmentan en rosetan se desarrollan en quistes en el invierno o pequeñas amebas, las cuales pueden dar inicio a otro ciclo.

Algunas características pricipales de Pelomyxa son:

1.  Son especies de vida libre polimórficas
2. Posee flagelos pequeñis inmóviles
3. Pueden ser anaeróbicas o micro-aerofílica
4. Su movimiento es dirigido por propulsión a chorro y por monopodium anterior

Muerte de la Ameba:
·        Al ser amenazadas con antibióticos a los cuales la bacteria endosimbiótica es sensible. Antes que la ameba muera, acido láctico y otros metabolitos se acumulan en el citoplasma. Se cree que las bacterias simbióticas saludables remueven y metabolizan el ácido láctico del citoplasma. 

domingo, 18 de septiembre de 2016

Thermonema lapsum una bacteria deslizante

En esta ocasión les hablare de una bacteria que tiene la característica de deslizarse por su hogar, este se encuentra en Nueva Zelanda. Esta es Thermonema lapsum.

La taxonomia de esta es:
Reino: Bacteria
Filo: Bacteroidetes
Clase: Cytophagia
Orden: Cytophagales
Familia: Fammeovirgaceae
Genero: Thermonema
Especie: T. lapsus (Hudson, et al. 1989)

Muy similar a una archaea de la que había escrito antes, esta bacteria también se encuentra en fumarolas. Solo que esta se encuentra en fumarolas volcánicas de Nueva Zelanda, al parecer son endémicas de ahí. Es una bacteria termofilica, no fotosintética y es móvil por deslizamiento. Crece en un ambiente aerobio a 60 grados C. Es muy probable que estas temperaturas se deban a que contiene una proporción menor de ácidos grasos a comparación de otros miembros de este grupo. 

Tiene una apariencia de ser Gram negativa, y no es muy ágil. Es decir su movimiento es lento y torpe. Posee la característica de que no crece en carbohidratos y que tiene un requisito de peptona para su nutrición. Unicamente crece en medios en donde se encuentran ácidos casamino y mezclas de amino ácidos. El genoma secuenciado mostró una abundancia de 47 GC, un largo total de la célula mayor a los 60μm y un diámetro de 0.25-0.3μm. Se obtuvieron 69 de las 70 firmas especificas de nucleotidos presentes en el dominio bacteria para el ARNr 16S. 

Algunas de las características interesantes e importantes del porque se estudian es su sensibilidad a la penicilina G. En estudios encontraron que todas las bacterias que fueron expuestas a la penicilina dieron positivo a sensibilidad, indicando que son intolerables a esta y también a la eritromicina. Al contrario todas fueron super resistentes al acido nalidixico a altas concentraciones. Esto tiene importancia porque nos puede dar una señal de que la penicilina puede ser un factor clave en la eliminación de las bacterias, ya que si esta que vive en condiciones tan extremas y tiene que ser muy resistente para sobrevivir es afectada las demás tienen una alta probabilidad de ser afectadas a un mayor nivel. 

Se podría profundizar en su estudio, ya que tiene la característica rara de que resiste al acido naldixico, el cual es un antibiótico para bacterias Gram negativas. Esto nos podría decir que muy probablemente en su hábitat abunde o existan concentraciónes altas de dicho acido y la bacteria evoluciono para ser inmune. Esto nos daría una opción mas sencilla, probablemente, de conseguir dicho acido. 

Fig. 1. Imagen electrónica de la pared celular con estructura Gram negativa. 

Referencias
Falkow, S., et al. The prokaryotes. Springer science & business media, Vol. 7, 1074 pp. 
Patel, B.,  et al. 1994. Phylogeny and lipid composition of Thermonema lapsum, a thermophilic gliding bacterium. FEMS: microbiology letters. Volume 115; 2:3, 313-317 pp. 

Escrito por:
Juan Pablo Gudiel
Estudiante de Biología de la UVG

Desulfurococcus mobilis una archaea similar a los eucaria basales

La archaea de las que les voy a hablar es una que se localiza únicamente en fumarolas acidas en Hveravellir, Islandia. La especie es Desulfurococcus mobilis. 

Su taxonomia es la siguiente
Reino: Archaea
Filo: Crenarchaeota
Clase: Thermoprotei
Orden: Desulfurococcales
Familia: Desulfuroccaceae
Genero: Desulfurococcus
Especie: D. mobilis (Zillig & Stetter, 1983)

Como ya había mencionado esta se encuentra en las fumarolas acidas de Islandia. Un lugar un poco común para encontrar este tipo de organismos. Esta es hipertermofila y utiliza caseina y peptidos que extrae del yeso. La caseina la utiliza como una fuente de energía y también de carbono. Es un coco esferoidal Gram negativo, con un diámetro que oscila entre los 0.1-1μm. A diferencia de otras pertenecientes a este genero esta posee un flagelo que forma un haz de 12.5 nm, es por esto el epíteto especifico de su especie. Su genoma ya a sido secuenciado mostrando una composición de 1,198,142 bases pareadas, siendo la GC la que mayor contenido a presentado, 52.89%. Esta compuesta por 1,277 genes que codifican proteínas y 54 genes ribosomales de ARN que codifican 1, 2, 41 y 10 de 16S y 23S ARN ribosomal, ARNt y otros ARN (Susanti, et al., 2016). 

Este blog tiene como finalidad conocer cual es la importancia de esta archaea para el mundo biológico o para nosotros los biólogos. Bueno esa importancia radica en dos cosas importantes encontradas en este organismo. No lo pondré en orden de importancia porque no se cual es el mas importante, aun así creyendo cual es el de mayor importancia no tengo una certeza segura. Lo primero que mencionare es la utilización del sulfuro como aceptor de electrones, esto es importante ya que al suceder la respiración de sulfuro se genera H2S y CO2. Esto es primordial para el inicio de la vida eucaríota (Susanti, et al., 2016). Según el libro "The Vital Question", escrito por Nick Lane, estos dos compuestos son esenciales para que la vida eucariota se pueda generar. En este libro también se menciona que la vida se tuvo que originar en dichas fumarolas y que gracias a la formación de los compuestos mencionados anteriormente se tiene una reacción exergonica. Lo que nos dice que había energía siendo liberada que pudo ser utilizada en la sopa primordial del origen de la vida. 

Esto se vincula muy fuertemente con la segunda importancia que tiene este organismo, el compartir con los eucaria mas basales un intron en el gen 23S ARNr. El intron del organismo en cuestión esta localizado en un "Hot Spot" del intron eucariotico ARNr y este se junta de una manera similar a los intrones ARNt eucariotico. Se puede decir que tanto los intrones ARNr y ARNt de los eucaria tienen un origen común con los de Archaea (Sebald, 2012). 

Por lo que aun se puede profundizar aun mas en el origen de esta archaea y poder vincularlo con el origen de los eucaria, alfinal de cuentas ya esta aceptado que son un solo reino "Arkarya". 

Fig. 1. Imagen de la archaea en cuestión. 


Referencias 
Sebald, M. 2012. Genetics and molecular biology of anaerobic bacteria. Springer science & business media. 705 pp. 
Susanti, D., et al. 2016. Permanent draft genome of Desulfurococcus mobilis type strain DSM2161, a thermoacidophilic sulfur-reducing crenarchaeon isolates from acidic hot springs of Hveravellir, Iceland.

Escrito por:
Juan Pablo Gudiel
Estudiante de Biología en la UVG